Akademickou obec zaskočilo prezidentovo rozhodnutí nejmenovat literárního vědce Martina C. Putnu profesorem, považuje to za zásah do akademických svobod. Krok prezidenta Miloše Zemana odsoudila i řada politiků napříč politickým spektrem, Zeman si tak prý rozšiřuje pole své působnosti. Jmenování profesorů je sice plně v kompetenci prezidenta, dřív ale hlavy státu návrhy akademiků respektovaly. Proti nejmenování už se ohradila Univerzita Karlova, kde Putna působí.
Například podle rektora Masarykovy univerzity v Brně Mikuláše Beka je Putna příkladem osobnosti, která má dostat profesorský titul. "Jsem navíc přesvědčený, že prezident má v takových záležitost respektovat odborné stanovisko grémií UK i jiných univerzit," nechal se slyšet Bek. Zároveň podpořil kroky Univerzity Karlovy, jejíž rektor Václav Hampl požádal prezidenta o vysvětlení.
"Jestliže je toto tvrzení pravdivé, pak je to velmi smutný zásah do základních univerzitních akademických svobod," myslí si také rektor brněnského VUT Karel Rais. Za velmi zvláštní označil postup prezidenta i rektor Ostravské univerzity Jiří Močkoř, upozornil ale, že ke komentáři není dostatek informací.
Podporu vyjádřil Putnovi i výtvarník Jiří David, který působí na Vysoké škole uměleckoprůmyslové v Praze. "Když jsem byl jmenován profesorem loni Václavem Klausem, byl jsem na pochybách jít na toto jmenování, pak jsem se rozhodl jít a vidět otrávený obličej, když mi gratuloval. Přesto jsem si jistý, že by jmenoval i vás. To, co nyní předvedl Zeman, je do nebe volající stupidita, nehoráznost spojená s nejnižším provincionalismem," napsal Putnovi.
Zeman své důvody nesdělil s tím, že nechce Putnu ponižovat, pokud by prý ale vědec dal celou věc k soudu, důvody zveřejní. Premiér Petr Nečas (ODS) se vyjádřil v tom smyslu, že jmenování profesorů je prezidentova věc, a je na něm, aby nejmenování vysvětlil.
Odstátnění profesorských řízení by napomohlo zavedení takzvaných funkčních míst, kdy by byl titul profesor nebo docent spjat vždy jen s univerzitou, která jej udělila. Tento návrh, který měl být součástí vysokoškolské reformy, ale akademici odmítli.