Česká republika má již nějakou dobu problémy s evropskými dotacemi, podle serveru iDnes.cz ale momentálně nejhorší od roku 2012, kdy byly dotace úplně zastaveny. Unie nebude proplácet další projekty, dokud ministerstvo pro místní rozvoj tyto problémy nevyřeší. Jde o dva programy, podle serveru kvůli nim může ČR v součtu přijít až o 100 miliard korun.
Brusel pozastavil Česku "Operační program podnikání a inovace", který je v režii ministerstva průmyslu a peníze z něj jdou na rozvoj podnikání. O jeho zastavení se ČR dozvěděla už v srpnu 2013. Druhým pozastaveným je "ROP Střední Čechy", který podporuje rozvoj středních Čech a byl zastaven ministerstvem financí v červenci 2012 v reakci na zatčení tehdejšího hejtmana Davida Ratha. "Komise zjistila několik problémů, které je třeba vyřešit, než bude možné proplácet další projekty," uvedla mluvčí komise Annemarie Huberová.
"Byly zjištěny nedostatky v řídícím a kontrolním systému," uvedl mluvčí ministerstva pro místní rozvoj Marek Ženkl. S detaily odkázal mluvčí na ministerstvo průmyslu, kde také nechtěli být konkrétní. "Nejsme účastníkem šetření OLAF (Evropská agentura pro boj proti podvodům) a nejsme oprávněni poskytovat informace," uvedl mluvčí Filip Matys.
Podle neoficiálních bruselských zdrojů je hlavním problémem skutečnost, že ministerstvo svěřilo v roce 2009 kontrolu evropských projektů Hospodářské komoře. Podle serveru v tom může být střet zájmů,neboť členy komory jsou desítky podniků, jež dotace inkasují.